Dans le domaine du transfert d'énergie par résonance de Förster (FRET), la sélection de paires donneur et accepteur (quencher) appropriées est essentielle à la conception réussie de sondes fluorescentes sensibles et spécifiques. Parmi les paires les plus établies et les plus utilisées figure la combinaison de l'EDANS (acide 5-((2-aminoéthyl)amino)naphtalène-1-sulfonique) comme donneur et de l'acide Dabcyl comme accepteur. Ce couplage a été essentiel dans le développement d'innombrables dosages biochimiques et de biologie moléculaire.

L'EDANS est un colorant fluorescent qui émet dans la région bleu-vert du spectre. Sa fluorescence est efficacement éteinte par les molécules qui absorbent fortement dans cette même région. L'acide Dabcyl, avec sa large bande d'absorption centrée autour de 430-450 nm, complète parfaitement le spectre d'émission de l'EDANS. Ce chevauchement spectral assure une efficacité FRET élevée lorsque les deux molécules sont à proximité. La possibilité d'acheter de l'acide Dabcyl et de l'EDANS auprès de divers fournisseurs scientifiques a rendu cette paire très accessible aux chercheurs.

La synergie entre l'EDANS et l'acide Dabcyl est exploitée dans de nombreuses applications. Dans la conception de substrats de protéases, une séquence peptidique clivée par une protéase cible est souvent flanquée par l'EDANS et l'acide Dabcyl. Lorsque le peptide est intact, la fluorescence de l'EDANS est éteinte par l'acide Dabcyl. Après clivage par la protéase, les molécules d'EDANS et d'acide Dabcyl sont séparées, et la fluorescence de l'EDANS est restaurée, signalant l'activité enzymatique. Cela permet une surveillance en temps réel de la cinétique enzymatique, un processus vital dans la découverte de médicaments et la compréhension des mécanismes des maladies.

De même, dans les sondes d'acides nucléiques, telles que les Molecular Beacons, la paire EDANS/acide Dabcyl est fréquemment utilisée. La structure de la sonde rapproche l'EDANS et l'acide Dabcyl en l'absence de la séquence cible, éteignant ainsi la fluorescence de l'EDANS. Lorsque la sonde s'hybride à sa cible, le changement conformationnel sépare la paire, permettant à l'EDANS de fluorescer vivement. Cette application est cruciale pour la PCR en temps réel et d'autres techniques d'analyse génétique. Les chercheurs recherchent souvent de l'« acide Dabcyl à vendre » ou du « colorant EDANS » pour se procurer ces composants.

La popularité durable de la paire FRET EDANS/acide Dabcyl découle de sa robustesse, de sa facilité de mise en œuvre et du signal clair qu'elle fournit. Bien que de nouvelles paires FRET aient été développées avec des gammes spectrales potentiellement plus larges ou une photostabilité améliorée, la combinaison EDANS/acide Dabcyl reste une référence en raison de ses performances éprouvées et de la richesse de la littérature soutenant son utilisation. Comprendre les propriétés spectrales spécifiques et les contextes d'application de l'EDANS et de l'acide Dabcyl est essentiel pour optimiser la conception des dosages basés sur le FRET. Le « prix de l'acide Dabcyl » constant et sa disponibilité auprès de nombreux fournisseurs solidifient encore sa position au sein de la communauté de recherche.