CAS 9002-07-7に分類されるトリプシンは、リシンおよびアルギニン残基のC端側を高い精度で切断するセリンプロテアーゼの代表格であり、プロテオミクス研究の最前線で欠かせない存在だ。当記事では、その分子レベルの作用機序から実際の実験手順まで幅広く紹介する。

トリプシンの活性中心には、ヒスチジン・アスパラギン酸・セリンからなる触媒三つ子が存在し、これがペプチド結合への求核攻撃を介してタンパク質を限定的かつ再現性よく切断する。この「分子のカッター」としての高精度こそが、質量分析や高速アミノ酸シークエンシングを成功させるカギとなる。

性状面では、冷凍乾燥した白色～淡灰白色粉末で、水に溶けやすく有機溶媒には不溶。自己消化を避けるため低温保管が必須である。また、比活性や純度規格を予め確認しておくことで、実験の再現性が飛躍的に向上する。プロテオミクスグレードの高純度試薬を求める場合、寧波イノファームケム株式会社が供給するトリプシンは、厳格な品質管理に基づく試薬プロファイルを提供しており、データ信頼性を高次元で維持できる。

具体的な利活用領域では、タンパク質同定・ペプチドマッピング・トランスレーションノーターゲットの制限酵素消化など、多岐にわたる。高純度なトリプシンは、酵素阻害研究やタンパク質間相互作用の動態解析にも広く応用される。特に、試料の複雑さが増す最新のビオマーカー探索では、安定供給かつ低自己消化の酵素が研究の進捗を左右する要因となる。

総じて、トリプシンは「高い切断特異性」「実験手順への容易な組み込み」「高生産性」という三点セットを兼ね揃えた、プロテオミクス研究者にとっての最強プレイヤーである。今後も質量感度が向上するにつれ、トリプシン由来ペプチド情報を起点とする包括的タンパク質機能解明が進むと期待される。